细胞是生物体的基本结构和功能单位，包括真核细胞和原核细胞两种。两种细胞最大的区别在于真核细胞有核和其他细胞器，而原核细胞没有，只有核区和细胞质。下面将从结构、代谢和生态方面分别介绍两种细胞的区别。
结构区别
真核细胞内部结构复杂，包括细胞膜、细胞壁、核膜、染色体、线粒体、内质网、高尔基体、溶酶体等许多细胞器。
而原核细胞由于没有核膜和其他细胞器，所以相对比较简单。普遍存在的结构主要有细胞壁、核区、线粒体、质粒、原核核糖体、鞭毛（或纤毛）、荧光素等。
代谢区别
真核细胞因为功能完备，繁殖速度慢，而代谢也相对缓慢，依赖氧气的呼吸和线粒体代谢产生的ATP，以及其他细胞器的协同作用来完成不同的生物过程。
原核细胞因为没有其他细胞器的协同作用，代谢方式相对单一，因此有相当多的机制具有特异性，例如产生氢化物、甲烷、硫酸盐起始进行呼吸、产生复杂的膜系统、靠阳光光合作用产生能量等。
生态位区别
真核细胞由于细胞体积较大、代谢缓慢，适应性较差，一般生活于较温暖、湿润的环境中。它们还有着更为复杂和多样化的生命活动，如有器官的动物、类脊动物和植物。
原核细菌具有无与伦比的适应性，能够生活在氧化或还原的环境下；生活在温度、压力、ph 值等极端条件的环境中，如产生肠炎、霍乱的细菌、产生腐败的特殊细菌等。
综上所述，真核细胞和原核细胞的差异很明显，但二者各具特色，都有自己在生命史上不可替代的作用。
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