琼脂糖凝胶电泳是常用的一种星散DNA的手艺。它是基于DNA的电泳特征举行星散的一种方式，具有简朴易行、便于考察、操作手艺简朴、星散效率高等优点。下面就基本的原理浅谈一下。
凝胶电泳是行使DNA在电场力下的迁徙速率差异而举行星散的一种手艺。琼脂糖凝胶电泳行使的就是琼脂糖凝胶所提供的差异孔径巨细的孔道举行星散。
琼脂糖凝胶具有网状结构，该结构有助于星散DNA。主体部门是由聚糖多聚合物组成的，其直径在100微米至数百微米之间。凝胶中所含有的水会形成许多细小的孔道，这些孔道的巨细与DNA的巨细相近或略大，因而较长的DNA分子在凝胶系统中的希望受到了一定的限制，形成了差异分子量的DNA片断。电泳历程中，在外加电场的作用下，DNA分子靠近电极静电吸引力而向电极偏向移动，由于分子量的差异，聚合电泳历程中，较小的DNA片断会更快地通过凝胶孔道，到达电极，而相对较大的DNA片断则移动较慢。
此外，DNA片断的星散效果还与差异离子条件下的电动力学行为有关。琼脂糖凝胶电泳操作简朴，星散效果好，但传统琼脂糖电泳有甲醛及乙醇等工艺，使用历程较为繁琐，而覆膜式琼脂糖电泳手艺则直接用热水笼罩琼脂糖凝胶外面，既利便又平安。
总之，琼脂糖凝胶电泳作为星散DNA的基本手艺，应用普遍。
