南方医科大学图书馆是南方医科大学内最重要的教学、科研、文化、信息传播的重要场所之一。南方医科大学紧扣医学发展的前沿，图书馆的内容也是如此。图书馆拥有大量的医学文献和资料，其中不乏一些国际顶级科研成果。在图书馆的分类中，医科书籍占据了半壁江山。师生们在这里可以找到几乎所有医学类别的书籍，比如基础医学、临床医学、口腔医学、护理学、公共卫生学、药学等等。
此外，图书馆的硕博士研究生阅览室也备受瞩目。宽敞明亮的会议室内，高档设施应有尽有，为研究生独有的学习、阅读和探讨提供了优美的环境和条件。馆内的自习室也相当出色，分为不同的区域，有安静的阅读区、多媒体借阅区和集中读书区，应有尽有。此外，图书馆还有专门的数字化图书馆，为读者提供24小时的数字资源查询服务。
